Le comptage, effectué en suivant le même protocole scientifique depuis son origine, nécessite une implication exceptionnelle :

 – il est mené durant trois mois (du 15 août au 15 novembre) car cette période est celle où l’intensité du passage est la plus élevée pour les espèces observables depuis ce site. Il faut savoir que toutes les espèces ne migrent pas à la même époque, le Milan noir par exemple, franchit les Pyrénées début août mais ne passe qu’en très petit nombre à Lizarrieta, raison pour laquelle nous ne débutons qu’au début du passage des Cigognes blanches et des Bondrées apivores, deux espèces phares du suivi.

– il est impératif d’être présent 7j/7 puisque le passage n’est pas homogène dans le temps et que certaines journées (parfois même le dimanche !) peuvent voir passer 30 à 40% des effectifs saisonniers d’une espèce !

– il doit être réalisé du lever au coucher du soleil car tous les oiseaux ne migrent pas aux mêmes heures de la journée. Certains attendent les heures les plus chaudes pour utiliser les ascendances thermiques afin de voyager à moindre frais énergétique alors que d’autres préfèrent les heures les plus fraîches ou bien se fichent pas mal de l’heure qu’il est pour migrer. Une part importante des espèces migratrices volent de nuit. Heureusement pour nous, l’essentiel des espèces que nous voyons le jour sont strictement diurnes, ce qui permet un comptage optimal.

– et tout cela quel que soit les conditions météorologiques puisque, même si le passage sera souvent moins abondant par temps de pluie, certaines espèces ne sont pas très regardantes, certains individus à la traîne pourront forcer le passage coûte que coûte, et des phénomènes encore incompris entraînent parfois des passages massifs par temps apparemment défavorable.